Você tem que ativar as quotas de disco em cada partição onde desejar este nível de controle. Isso é feito no "Configurador de sistemas de arquivos". Acesse o menu "Acesso dispositivo local" e escolha cada partição onde se desejar ativar as quotas de disco. Você encontrará opções para quotas de usuários e quotas de grupo.
Novamente: estas quotas (usuário e grupo) são independentes entre si e podem ser ativadas separadamente.