När avstängning sker ordentligt så sker en demontering av alla filsystem (via program umount). Root-filsystemet ställs om till enbart läsning. För alla filsystem, inklusive root-filsystemet, sätts markering ok. Denna markering kontrolleras för varje filsystem i samband med nästa uppstart för att avgöra om det behövs en filsystemskontroll innan uppstarten kan fullföljas. Detta försäkrar att filsystemsstrukturen fungerar efter ett oavsiktligt maskinstopp (t ex strömavbrott). Det hjälper inte mot informationsförluster: En ordentlig avstängning är alltid bra att göra.