4. /var/named/root.cache

Si su DNS está delegando peticiones a otra, no necesita el archivo /var/named/root.cache.

Equivocado!

Este archivo da la información imprescindible al bootstrap para la resolución del nombre en otro dominio. Sin este archivo, su DNS sencillamente que no existe nada más que el dominio al que sirve. No mirará más allá.

Esto es el porqué de que Linuxconf siempre intenta añadirlo a su configuración DNS.