O Linux pode ser inicializado de um disquete ou usando-se o loadlin. Isso não tem muito a ver com o LILO, mas é importante saber. Assumindo que sua partição raiz do Linux é /dev/hdaX...
Para criar um disquete de inicialização, faça:
Para inicializar com o loadlin (um programa DOS), copie o arquivo do kernel para sua partição DOS e digite, no prompt do DOS:
loadlin zimage root=/dev/hdaX ro